Die Pflanzenmorphologie ist die Wissenschaft von der äußeren Gestalt (Morphe, Phänotyp) der Pflanzen. Sie stellt das konzeptionelle und terminologische Rüstzeug für die Pflanzenwissenschaften zur Verfügung.
Die Pflanzenmorphologie ist eine der ältesten Disziplinen der Botanik und hat eine lange, kontroverse Geschichte durchlaufen. Im deutschsprachigen Raum wurde sie stark vom typologischen Konzept Wilhelm Trolls beeinflusst, was zu einer jahrelangen Isolation führte.
Heute ist die Pflanzenmorphologie evolutionsbiologisch ausgerichtet. Sie beschränkt sich nicht auf die Beschreibung von Merkmalen, sondern befasst sich mit grundsätzlichen Fragen der Entwicklung, Funktion und Evolution von Strukturen. Enge Bezüge bestehen zur Biomechanik, Ökologie, phylogenetischen Systematik und Entwicklungsgenetik.
